Agnė Caldara vargonų bakalauro ir magistro laipsnius įgijo Lietuvos muzikos ir teatro akademijoje. 2006 m. stažavosi Olandijoje, Groningeno konservatorijoje, prof. T.Jellema vargonų ir prof. J.Hofmann klavesino klasėse. Vargonininkė dalyvavo žymiausių Europos profesorių meistriškumo kursuose. 2005 m. A.Caldara pelnė III-ąją premiją J.Naujalio jaunųjų vargonininkų konkurse (Vilnius), 2012 m. ji tapo IV- ojo Jono Žuko vargonininkų konkurso III premijos laureate. 2011-2020 m. A.Caldara buvo Vilniaus arkikatedros bazilikos, 2015-2020 m. - Aušros Vartų (Šv. Teresės) bažnyčios vargonininkė. 2017 m. ji vargonavo pal. Teofiliaus Matulionio beatifikacijos Mišiose Vilniaus arkikatedroje, 2018 m. grojo Popiežiaus Pranciškaus aukojamų Mišių Kauno Santakoje metu. Kaip solistė ir su įvairiais kolektyvais ji koncertavo Danijoje, Vokietijoje, Belgijoje, Olandijoje, Šveicarijoje, Ispanijoje, Italijoje ir Lietuvoje. Nuo 2017 m. A.Caldara yra Nacionalinės vargonininkų asociacijos narė (2017-2020 - Valdybos narė), viena iš Šv. Grigaliaus bažnytinės muzikos studijų iniciatorių, šių studijų vadovė ir lektorė (2018-2021). Nuo 2023 m. ji yra Miuncheno (Vokietija) Šv. Jurgio bažnyčios vargonininkė.